'tRNA-lys' mutations and comparisons

The transfer RNA for lysine is one of the transfer RNA's of 'mitochondrial DNA'.
It is located at Bases 8295 - 8364.

                8295            8308             8321                      8343
Homo sapiens    CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
Pan paniscus    cactgta aa gcta acc tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag gaccaacac ctctt tacagtg a
Pan troglodytes cactgta aa gcta acc tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag gaccgacac ctctt tacagtg a
Gorilla gorilla cactgta aa gcta acc tagc g ttaac cttttaa gttaa agatt aagag tatcggcac ctctt tgcagtg a
Pongo pygmaeus  cattgca aa gcta acc tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aagag aaccagcct ctctt tgcaatg a
Pongo abelii    cactgca aa gcta atc tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aagag aatcaaccc ctctt tgcagtg a
Hylobates lar   cactgta ga gcta aat tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aagag gaccactac ctctt tacagtg a
Macaca Sylvanus cactgta ca gcta tcc tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg ggggc aaagacaca ccctc tgcagtg g 
Macaca Mulatta  cactgta ta gcta tct tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg gggga caca      ccccc tacagtg a
Papio hamadryas cactgta ca gcta ttc cagc a ttaac cttttaa gttaa agatt gaggg catg      ctctc tgcagtg a
Cercopithicus   cgctgca ta gcta ttc tagc g ttaac cttttaa gttaa aaatt gaggg gaata     ccctc tgcagcg a
Colobus Guereza cgctgta ca gcta tta tagc a ttaac cttttaa gttaa agatc gagaa acccttc   ttctc tacagcg a
Trachypithecus  cactgta ta gcta cta tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg aggat acact     ttctc tgcagtg a
Cebus albifrons cactgta aa gcta ct  tagc a ttaac cttttaa gttaa agaca gagag aat       ctctc tacagtg a
Nycticebus      cactgtg aa gcta at  aagc g ttaac cttttaa gttaa agatt gaaag ttataagaa ctgtc cacagtg a 
Lemur Catta     cactacg aa gcta at  tagc a ttaac cttttaa gttaa agact gaaag ctcaaac   ctttc cgcagtg a
Tarsius         cactgcg aa gctt ata tagc a ttaac cttttaa gttaa agacc gaaag tactaat   ctttc cacagtg a
Tupaia          cactatg aa gcta g   tagc g ctaac cttttaa gttag agata aggga ctccaca   acccc catagtg a
Cynocephalus    catcgtg aa gctg aa  cagc a ttaac cttttaa gttaa agaat ggaag tactaac   cttcc cacaatg a

Human NUMT sequences:-
NT_004350.18|Hs1_4507   chromosome  1      47476-47545
                CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NT_019273.18|Hs1_19429  chromosome  1    3253959-3253899
                CACTGCA AA GCCA TC. CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG GATCTGCAC TTCTC
NT_005403.16|Hs2_5560   chromosome  2   53689677-53689745
                CACTGTA AA GCTA TC. TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATG GAGGG GATCTGCAC CTATT TGCAGTG A
NT_005403.16|Hs2_5560   chromosome  2   52624451-52624473
                                      GC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGA
NT_022135.15|Hs2_22291:9676329-9676397   Homo sapiens chromosome 2
                CCCTGCT AG GCCC TG  AATA A TTAAC CTTTGAA GTTAA AGACT GAAGG GATCTATAC CCCTC TGCAGTG A
NT_022135.15|Hs2_22291  chromosome  2   32566332-32566264
                CACTGTA AA GTTA TC. CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAT GATCTACAC CTCTC TACAGTG A
NT_022184.14|Hs2_22340  chromosome  2   66867953-66868003
                                       C A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NT_022459.14|Hs3_22615:c23343878-23343810 Homo sapiens chromosome 3
                AACTGTA AA GCTA CC. AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGGT GATCTATAC CTCTC TGCAGTG A
NT_016354.18|Hs4_16510  chromosome  4   80928165-80928097
                CACTGTA AA ACTA TC. TAGC A TTAAA CTTTTAA GTTAA AGACT GAGCG GATCTACAC CTCTC TGCAGTG A  
NT_034772.5|Hs5_34934:c1803546-1803477    Homo sapiens chromosome 5
                CACTGTA AA GTTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG AATCACTAC CTCTT TACAGTG A
NT_025741.14|Hs6_25897:58091961-58092028  Homo sapiens chromosome 6
                CACTGTA AA GCTA A.T TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGGA TTCTAAAC  TCCCC TGCAGTA A
NT_007758.11|Hs7_7915   chromosome  7    6829024-6828984
                CACTGTA AA GCTA ATC TAGC A CCAAC CTTTTAA GTTAA AGA
NT_023629.12|Hs7_23785 233200-233269      Homo sapiens chromosome  7
                AAAAAAA AA GCTA CCC CAGT G TTAAC CTTTTCA GTTAA AGGCT GAGAG AAATCACAC CTCTC TACAGTG A
NT_023629.12|Hs7_23785  chromosome  7    256461-256530
                CACTGTA AA GCTA CCC CAGC G TTAAC CTTTTCA GTTAA AGACT GAGAG AAATCACAC CTCTC TACAGTG A
NT_008046.15|Hs8_8203:56714060-56714108   Homo sapiens chromosome 8
                        AG GCTA A.C TAGC A TTAAC CTTTTAA ATTAA AGACT GAGGT TAGGCACAG
NT_008413.17|Hs9_8570:5089335-5089403     Homo sapiens chromosome 9
                CACTGTA AA GCTA TT. CAGC A TTTAC CTTTTAA GTTAA AGATT GACGG AGTCTACAC CTCTC TGCAGTG A
NT_008583.16|Hs10_8740  chromosome 10   19901487-19901443
                CACTGTA AA GCTA A.T TAGC A TTAAC CTTTAAA GTTAA AAACT GAG
NT_030059.12|Hs10_30314 chromosome 10   20566184-20566115
                CACTGTA AA GCTA ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCATTAT CTCTT TACAGTG A
NT_033899.7|Hs11_34054  chromosome 11    6836634-6836567
                CACTGTA AA GCTA .CT TAGC T TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG G.TCTACAC CTCTC TGCAGTG A  
NT_024524.13|Hs13_24680 chromosome 13   38758974-38759011
                        AA GCTA AC. TAGC A TTAAC CTTTTAA TTTAA AGACT GAG
NT_024862.13|Hs17_25018:345944-346013     Homo sapiens chromosome 17
                CACTGTA GA GCTG ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCGCTAT CTCTT TACAGTG A
NT_011520.11|Hs22_11677 chromosome 22   15960527-15960573
                CACTGTG AA GCTA A.T TAGC A TTAAC CTTTTAT GTTAA AGACC GAGAG
NT_011651.16|HsX_11808  chromosome  X   10404775-10404707
                CACTGTA AA GCTA .CC CAGC A TTCAC CTCTTAA GTTAA AGACT GAGGG GATCTTCAC CTCTC TACAGTG A
NT_011651.16|HsX_11808  chromosome  X   25349415-25349446
                                AAA TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GA


CRS             CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A

...................
Pan troglodytes cactgta aa gcta acc tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag gaccgacac ctctt tacagtg a

NW_001229479.1 Pan troglodytes NUMT chromosome  1    19839-19908
                CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NW_001229480.1|Ptr1_WGA1712_2:5311-5370 Pan troglodytes chromosome 1 
                            CTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACTAACAC CTCTT TACAGTG A
NW_001232828.1|Ptr3_WGA3385_2:c2791296-2791228
                AACTGTA AA GCTA .CC AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGGT GATCTATAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001232075.1|Ptr2B_WGA2632_2:5986074-5986142 Pan troglodytes chromosome 2B
                CCCTGCT AG GCCC  TG AATA A TTAGC CTTTGAA GTTGA AGACT GAAGC GATGTATAC GTCTC TGCAGTG A
NW_001232828.1|Ptr3_WGA3385_2:c2791296-2791228 Pan troglodytes chromosome 3
                AACTGTA AA GCTA  CC AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGGT GATCTATAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001234090.1 Pan troglodytes NUMT chromosome  4 1346097-1346029
                CACTGTA AA GCTA TC. TAGC A TTAAA CTTTTAA GTTAA AGACT GAGCG GATCTACAC CTCTC TGCAGTG A 
NW_001235417.1 Pan troglodytes NUMT  chromosome 5  5771624-5771693
                CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG AATCACTAC CTCTT TACAGTG A
NW_001238034.1|Ptr7_WGA8591_2:c950435-950383 Pan troglodytes chromosome 7
                CACTGTA AA GCTA ATC TAGC A CCAGC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGA GATCT
NW_001240344.1|Ptr8_WGA9911_2 64583-64652 Pan troglodytes chromosome 8
                CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NW_001240439.1|Ptr9_WGA10996_2:4420380-4420448   Pan troglodytes chromosome 9
                CACTGTA AA GCTA TT. CAGC A TTTAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG AGTCTACAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001220741.1|Ptr10_WGA12305_2:c12750943-12750874 Pan troglodytes chromosome 10
                CACTGTA AA GCTA ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCATTAT CTCTT TACAGTG A
NW_001222311.1|Ptr11_WGA13875_2:c6933922-6933855 Pan troglodytes chromosome 11
                CACTGTA AA GCTA CT. TAGC T TTAAC CTTTTAA GTTAA GGACA GAGGG GTCTACAC  CTCTC TGCAGTG A
NW_001227452.1 Pan troglodytes NUMT chromosome 17   369880-369949
                CACTGTA GA GCTG ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCGCTAT CTCTT TACAGTG A

...................

Macaca Mulatta  cactgta ta gcta tct tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg gggga caca      ccccc tacagtg a

NW_001112552.1 Macaca NUMT Chromosome  2
                CACTGTA CA GCTA TCC TAGC A TTAAC GGGGTAA GTTAA AGACT GGGGG ACACA     CCCTC TGCAGTG A
NW_001114168.1 Macaca NUMT Chromosome  3  3474706-3474643
                CACTGTA TA GCTA TCC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACG GGGG- CACA      CCCCC TACAGTG A
NW_001118162.1 Macaca NUMT chromosome  5  6371225-6371157
                CACTGTA AA GCTA TC. TAGC A TTAAT CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG GATCTACAC TTCTC TGCAGTG A
NW_001122891.1 Macaca NUMT chromosome  8   767498-767561
                CACTGTA TA GCTA TCC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATG GGGG- CACA      CCCCC TGCAGTG A
NW_001122911.1 Macaca NUMT chromosome  8  7374251-7374202
                CACTGTA CA GCTG CCC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC AAGAG AA 
NW_001122895.1 Macaca NUMT Chromosome  8  3001101-30011037
                CACTGTA CA GCTA TCC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACG GGGGA CACA      CCCCC TGCAGTG A  
NW_001098161.1 Macaca NUMT chromosome 12 12194300-12194368
                CACTGTG AA GCTA TC. TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAT AGACT GAGGG GATCCACAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001099020.1|Mmu13_WGA19583_1:548705-548791 Macaca mulatta chromosome 13
                TCCCTGC TG GCCC TG  AATA A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAAGG GATCTAT   ACCTC TGCAGTG A
NW_001100388.1 Macaca NUMT chromosome 14  6163952-6163884
                CACTGTC AA GCTA .CT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAA GACCTACAC CTCTC TGTAGTG A  
NW_001101664.1 Macaca NUMT chromosome 15   396591-396523
                CACTGTA AA GCTA TT. CAAT A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGGG GGTCTACAC CTTTC TGCAGTG A
NW_001218128.1 Macaca NUMT chromosome  X     4569-4520
                CACTGTA CA GCTG CCC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG AA
NW_001218158.1 Macaca NUMT Chromosome  X   533304-533236
                CACTGTA AA GCTA CC. CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG AGTCTTCAC CTCTC TACAGTG A

...................

Bos taurus      CACTAAG AA GCTA TA. TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CCATATA   CTCTC CTTGGTG A

NW_001493748.1|Bt1_WGA132_3:648030-648097     Bos taurus chromosome  1
                ATTCATT AA GCTA AGC TAGC A CTAGC CTTTTAA GTTGG AGATT GGAAG TTAAATT   CCCTT TAATGAT A
NW_001493852.1|Bt1_WGA45_3:c43498-43433       Bos taurus chromosome  1
                CATTAAG AA GCTG AAT .AGT A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG TTAAAA    TCTCC CCTTAGT G
NW_001494560.1|Bt2_WGA208_3:769776-769843     Bos taurus chromosome  2
                CATCAAG AA GCTA TAT CAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CATAATA   CTCTC CTTGGTG G
NW_001494819.1|Bt3_WGA467_3:269877-269943     Bos taurus chromosome  3
                CACCAAG AA GCTA TA. CAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CATCATA   CTCTC CTTGGTG A
NW_001493134.1|Bt13_WGA1642_3:112535-112572 Bos taurus chromosome 13
                CGTAAGA AA GCTA AAT TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG 
NW_001493926.1|Bt20_WGA2234_3:c391538-391472  Bos taurus chromosome 20
                CATTAAG AA GCTA A.A TAGT A TAAAC TTTTTAA GTTAA AAACT GAGAA TTTCAAC   ATTTC CCTAAGG A
NW_001494260.1|Bt24_WGA2568_3:1880802-1880869 Bos taurus chromosome 24
                CATTAAA AA GATA AAT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AAATT GAGAG TCAAAAC   TCTCC TTAAAGT C
NW_001508704.1|BtX_WGA2892_3:100092-100159    Bos taurus chromosome  X
                CATTAAG AA GCTA AAA TAGC A TTAAC CTTTTAG GTTAA AAACT GAGAG TCTTGAC   CTTGG ATCAATG A

...................

Human Mutations found in published genealogical sequences:-
CRS             CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A

A8296G
AP008839(Japan) cgctgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a 
C8297-
EF657285(Eur.)  CA.TGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8298C
AY195775(Eur.)  caccgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a 
A8301G
EU092905(Africa)CACTGTG AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
A8308G
AY714040(India) cactgta aa gcta gct tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a
T8310C
DQ304955(Afr_A) CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8311C
DQ341066(Ethi.) CACTGTA AA GCTA ACT CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
G8313A
DQ779928(Geor.) CACTGTA AA GCTA ACT TAAC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8329G
DQ112735(Burk.) cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa ggtaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a
G8334A
EF657608(Asia)  CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AAATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
A8343G
EF657786(Eur.)   CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACCAACAC CTCTT TACAGTG A
A8344G
AY195750(Eur.)  cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag agccaacac ctctt tacagtg a
C8346-
EF184596(Tanz.) CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AAC.AACAC CTCTT TACAGTG A
A8347G
AY495328(Eur.)  cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccgacac ctctt tacagtg a 
A8348G
AY738975(Eur.)  cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccagcac ctctt tacagtg a

Neandertal
AM948965
A8348G          CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAGCAC CTCTT TACAGTG A


The mutations are present in these haplogroups:

A8296G  -  D11 M29
C8297-  -  T2
T8298C  -  H1
A8301G  -  L2a
A8308G  -  H1 M7 N1c U2e
T8310C  -  J1c L2a
T8311C  -  L3  (L3x?)
G8313A  -  M1a
T8329G  -  L1 L2c
G8334A  -  A
A8343G  -  B G2 H H5
A8344G  -  H7 V
C8346-  -  L0f
A8347G  -  A2 L3 V
A8348G  -  H1 L1




2008